La zona del comune di Agliana, ci è nota fin dai tempi dei romani quando nella "Tabula Peuntigeriana", veniva identificata come zona abitata.
Il nome risale presumibilmente al toponimo del torrente "Agna".
Il territorio passò sotto diverse dominazioni, dai conti Guidi alla famiglia fiorentina dei Pazzi, per poi entrare a far parte dello stato fiorentino ed essere unificata al territorio di Montale.
La zona di Agliana ha dovuto il suo sviluppo grazie all'importante strada "Cassia" che collegava Firenze a Pistoia e Lucca.
Inoltre un altro fattore che ha inciso notevolmente sullo sviluppo del paese e stato il risanamento della pianura circostante.
Il comune è autonomo dal 1913, ed è entrato a far parte della nuova provincia di Pistoia nel 1927.